一般而言，有关于办理留抵跟税存在风险的企业，其主要有以下这些:

一、不符合留抵退税的条件

这些情形包括:

1、企业的纳税信用等级不是A级或者B级;

2、申请退税前36个月内存在骗税、虚开发票及偷税被处罚的情况。

3、享受过即征即退等政策。

4、不属于小微企业或制造业等特定行业企业。

二、销项税额存在问题

申请留抵跟税时，企业销项税额小干进项税额。风险分析如下：

1、存在隐屠收入的情况，比如取得销售款挂账，或者私户收款，或者销售不开票未申报情况等。

2、企业存在视同销售行为，未按规定计提销项税的情况，比如将设备或货物对外投资、捐赠、偿债等，以及自产货物用于简易计税、免征增值税及集体福利等。

3、企业收取的价外费用未按规定计提销项税额。

4、企业发生的混合销售及兼营，适用税率不正确，存在故意适用低税率的情况。

5、企业存在通过注册空壳小规模纳税人，通过低税率和免征等税收优惠转移销售收入问题

三、进项税额存在问题

进项税额最人的问题就是取得点开的增值税专用发票，虚抵进项税额。

而针对进项税额，需要关注企业是否发生需要进项税额转出的情形，比如;取得专票的采购业务，是否用干免征增值税及管易计税项目，是否用干集体福利及个人消费等。

四、进销项不匹配

进销项匹配要关注购进的货物是否和销售的货物具有逻辑一致性。如若不匹配，则存在税务风险。除此之外，企业还要关注自身是否存在有进无销、进大销小，是否存在进销同步变动异常等行为。如若存在，也无法办理。

综上，对于需要办理留抵退税的企业来说，需结合本企业自身情况自查后来判断自身是否存在相关风险，如若本企业符合退税条件，可以大胆的去申请退税，不用担心税局稽查，如果通过自查后，本企业不符合退税条件，则可以选择放弃退税优惠，写明理由提交即可。